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17世纪，五世达赖喇嘛非常重视藏医事业的发展，曾创建了哲蚌寺索日卓翩林、日喀则索日常松堆白林、布达拉宫拉旺角、桑普尼玛塘等藏医学校。五世达赖喇嘛的第司桑结嘉措，为藏医事业做出了不可磨灭的贡献。
1689年他完成《<四部医典>释论·蓝琉璃》一书；1690年编著了《秘廖续补注》一书；1703年完成了《医学概论·仙人喜筵》一书，这些著作成为许多医生治疗的参考依据和研习医术的最佳典籍。第司桑结嘉措还根据《月王药诊》和自己所著《蓝琉璃》、《医学概论》以及强巴派医学理论、伦顶朗杰多吉所传《续义释论》等内容加以补
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 充和整理，首创医学唐卡挂图79幅。第司桑结嘉措非常重视人才的培养，1696年他创建了药王山日齐卓翩林医学院，培养了一批医学人才，他们著书立说，传播医理，饮誉全藏，在当时的历史条件下，达到了藏医发展的较高水平。
十三世达赖喇嘛时期，藏医学也有一定的发展。此时出现了许多著名的藏学家，诸如噶玛吉美吉森
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 格、喇嘛吉美赤列、太医乌坚丹增嘉措、多吉坚赞、扎康基巧堪布强巴土旺、恰布巴当曲班丹、钦饶罗布大师等。他们编著医书，传授医理，推动了藏医事业的发展。 |
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